Datenvisualisierung mit

Matplotlib

Als erstes: IPython interaktiv machen:

In [1]:
%matplotlib inline
# bei euch: %matplotlib (nur in iPython)

Um mit Matplotlib arbeiten zu können, muss die Bibliothek erst einmal importiert werden. Damit wir nicht so viel tippen müssen geben wir ihr einen kürzeren Namen:

In [2]:
import matplotlib.pyplot as plt
plt.rcParams['figure.figsize'] = (10, 8)
plt.rcParams['font.size'] = 16
plt.rcParams['lines.linewidth'] = 2

Außerdem brauchen wir ein paar Funktion aus numpy, die euch schon bekannt sind

In [3]:
import numpy as np

Ein einfaches Beispiel: $f(x)=x^2$

In [4]:
x = np.linspace(0, 1) # gibt 50 Zahlen in gleichmäßigem Abstand von 0–1
plt.plot(x, x**2)
# Falls nicht interaktiv: 
# plt.show()
Out[4]:
[<matplotlib.lines.Line2D at 0x7f6ab82d42b0>]

Anderes Beispiel: $\sin(t)$ mit verschiedenen Stilen. Vorsicht, die Funktionen und $\pi$ sind Bestandteil von numpy

In [5]:
t = np.linspace(0, 2 * np.pi)
plt.plot(t, np.sin(t))
Out[5]:
[<matplotlib.lines.Line2D at 0x7f6aab5aeeb0>]
In [6]:
plt.plot(t, np.sin(t), 'r--')
Out[6]:
[<matplotlib.lines.Line2D at 0x7f6aab521400>]
In [7]:
plt.plot(t, np.sin(t), 'go')
Out[7]:
[<matplotlib.lines.Line2D at 0x7f6aab505100>]

Tabelle mit allen Farben und Styles: matplotlib.axes.Axes.plot

Neue Grenzen mit xlim(a, b) und ylim(a, b)

In [8]:
plt.plot(t, np.sin(t))
plt.xlim(0, 2 * np.pi)
plt.ylim(-1.2, 1.2)
Out[8]:
(-1.2, 1.2)

Es fehlt noch etwas...

XKCD comic on why you should label your axes.

In [9]:
with plt.xkcd():
    plt.title('Axes with labels')
    plt.plot(t, np.sin(t))
    plt.xlabel('t / s')
    plt.ylabel('U / V')
    plt.ylim(-1.1, 1.1)
    plt.xlim(0, 2 * np.pi)
findfont: Font family ['xkcd', 'xkcd Script', 'Humor Sans', 'Comic Neue', 'Comic Sans MS'] not found. Falling back to DejaVu Sans.
findfont: Font family ['xkcd', 'xkcd Script', 'Humor Sans', 'Comic Neue', 'Comic Sans MS'] not found. Falling back to DejaVu Sans.

Achsen-Beschriftungen können mit LaTeX-Code erstellt werden → LaTeX-Kurs in der nächsten Woche.

In [10]:
plt.plot(t, np.sin(t))
plt.xlabel(r'$t / \mathrm{s}$')
plt.ylabel(r'$U / \mathrm{V}$')
Out[10]:
Text(0, 0.5, '$U / \\mathrm{V}$')

Einheiten in Achsenbeschriftungen werden wegdividiert:

In [11]:
plt.plot(t, np.sin(t))
plt.xlabel(r'$t / \mathrm{s}$')
plt.ylabel(r'$U \,/\, \mathrm{V}$')  # Spaces sind Geschmacksfrage……
Out[11]:
Text(0, 0.5, '$U \\,/\\, \\mathrm{V}$')

Mehr zu Einheiten gibt es im LaTeX-Kurs.

Legende

Legenden für Objekte die ein label tragen

In [12]:
plt.plot(t, np.sin(t), label=r'$\sin(t)$')
plt.legend()
#plt.legend(loc='lower left')
#plt.legend(loc='best')
Out[12]:
<matplotlib.legend.Legend at 0x7f6aab21e0d0>

Seit matplotlib 2.0.2 ist loc=best standardmäßig eingestellt.

Andere möglche Orte für die Legende findest du hier:

https://matplotlib.org/api/legend_api.html

Gitter

Mit grid() wird ein Gitter erstellt:

In [13]:
plt.plot(t, np.sin(t))
plt.grid()

Laden von Daten

In [14]:
x, y = np.genfromtxt('data/example_data_linear.txt', unpack=True)
plt.plot(x, y, 'k.')

t = np.linspace(0, 10)
plt.plot(t, 5 * t, 'r-')
Out[14]:
[<matplotlib.lines.Line2D at 0x7f6aab4d5850>]

Auslagern in ein Skript

Speichert den folgenden Code in eine Textdatei plot.py ab.

Öffnet ein Terminal und startet das Programm:

python plot.py
In [15]:
import matplotlib.pyplot as plt
import numpy as np

x = np.linspace(0, 1)
plt.plot(x, x**2, 'b-')
plt.savefig('plot.pdf')

Mit savefig speichert man die Abbildung.

In diesem Fall sollte die Datei plot.pdf erstellt worden sein.

Es gibt viele Ausgabeformate: pdf, png, svg, LaTeX

Um mehrere Plots zu speichern kann man plt.clf() verwenden. Der Befehl leert die aktuelle figure und steht für clear figure.

In [16]:
import matplotlib.pyplot as plt
import numpy as np

x = np.linspace(0, 1)

### Plot 1
plt.clf()


plt.plot(x, x**2, 'b-',label='Plot 1')
plt.legend()
plt.savefig('plot_1.pdf')

### Plot 2
plt.clf()

plt.plot(x, x**3, 'r-')
plt.savefig('plot_2.pdf')

Komplexere Abbildungen

Natürlich kann man mehrere Linien in einen Plot packen:

In [17]:
x = np.linspace(0, 1)

plt.plot(x, x**2, label=r'$x^2$')
plt.plot(x, x**4)
plt.plot(x, x**6, 'o', label=r'$x^6$')

plt.legend()
Out[17]:
<matplotlib.legend.Legend at 0x7f6aab10a4f0>